>Оказалось, что приложение обновилось
вот это уже не FOSS. FOSS не может обновляться против желания юзера, я полагаю. так делает только гнилая проприетарщрна.
я долго убивала всякие попытки разного софта обновляться, ибо нефиг. вопрос с обновлением должен решать админ системы. а приложение должно работать и даже не пытаться куда-то лезть, ибо это не его дело и не должно быть у него таких прав. устанавливать что-то может только рут и если всякая хрень может с рутовыми правами себя "обновлять" - это какая-то полная жопа и вредоносное ПО, а не FOSS.