Ну, так-то да. Версионные БД потому и версионные, что обновлять записи по-другому несколько дорого, да и черевато всяким.
А вот, в случае какого эвент сорсинга, весь этот GDPR сильно ломает концепт. И, если бы авторы GDPR думали чуть больше, они бы вместо удаления исторических данных, криминализировали их использование.