Накапливая статистику сколько вы отправили в Телеграм, а сколько получили другие от Телеграма в тот же момент — можно построить сеть связанных людей.
Само собой надо учитывать только тех пользователей, кто сейчас онлайн и что размер пакета плавает.
Но big data тут поможет.
Поэтому когда вы будете придумывать свой шифрованный протокол не полагайтесь только на шифрование.
Вы должны вносить хаос в данные, чтобы препятствовать такого анализу статистики метаданных.
Разбивать сообщение на разные пакеты, вносить случайный шум.