Флатпаки такая странная штука, скажу я вам.
Уже несколько месяцев у меня не работала флатпак версия FreeTube (https://freetubeapp.io/), запущенная через иконку, она вылетала через пару секунд после прогрузки. А через команду "flatpak run io.freetubeapp.FreeTube" - идеально.
Потом, я заметила, что некоторые приложения флатпака дают уведомление, мол, X работает в фоновом режиме, и если я пробую вырубить это, то программа тут же начала схожий симптом испытывать и вылетать после запуска.
Я решила заглянуть в flatseal и просто дать разрешения фритубу на работу в фоновом режиме, и, что бы вы думали? Он вновь заработал как положено,,,,,,