Не понимаю, почему так много шума вокруг системы организации заметок linking your thinking. Безусловно, в ней есть толковые идеи, мне приглянулись метазаметки в виде moc'ов и home note. А вот директории, теги и ссылки я вовсе не использую и в остальном нахожу lyt избыточным.