Исследователи из Израиля и США проанализировали грибковый состав более 17 000 образцов опухолей и здоровых тканей. Они установили его связь с типом рака, стадией, выживаемостью, иммунным ответом и другими параметрами: pcr.news/novosti/sostavlen-atl

Сначала ученые убедились, что в опухолях присутствует ДНК грибов. Для этого они исследовали две группы образцов, которые раньше также изучали на наличие бактерий. К первой группе (Weizmann, WIS) относились образцы из восьми типов тканей, как здоровых, так и раковых. В этой группе проводили ампликонное секвенирование, то есть секвенирование фрагмента генома. Во второй группе анализировали данные полногеномного секвенирования и секвенирования РНК из масштабной базы данных — Атласа ракового генома (The Cancer Genome Atlas, TCGA [portal.gdc.cancer.gov/]).

#новостинауки #научпоп