В расширении вкладок в контейнерах можно задать прокси для каждого контейнера (в том числе и Shadowsocks), но контейнеры игнорируют настройку "Проксировать DNS запросы через SOCKS5".

Но есть отдельное более удобное расширение которое позволяет настраивать прокси для каждого отдельного контейнера и там есть поддержка проксирование DNS запросов:

https://addons.mozilla.org/en-US/firefox/addon/container-proxy/

<!> НО! Если вы используете uBlock Origin, то отключите настройку "Раскрывать CNAME записи", иначе получите DNS leak - будут и адреса вашего и провайдера и прокси.

Если вас это не устраивает, тогда вам остается создавать для Firefox отдельный профиль настроек (команда: firefox -P)

@rf