@Revertron @rf
Сперва попробовать очистить неиспользуемые файлы:
https://docs.joinpeertube.org/maintain-tools?id=prune-storagejs
Потом уже смотреть какие файлы используются в таблице videoFile в базе данных PostgreSQL. Неиспользуемые файлы очистить вручную.
Если не помогло, то уже надо редактировать базу данных вручную и удалять дубликаты видео - один файл с поддержкой HLS, другой - без поддержки. Сравнивать надо по значениям в столбцах videoid и videoStreamingPlaylistId.