Почва в городах часто загрязнена химикатами, тяжелыми металлами, следовыми количествами антибиотиков и резистентными к антибиотикам бактериями. В некоторых случаях компост и обработанный навоз могут снизить количество «плохих» бактерий. Ученые анализировали капусту и салат с семи городских участков в Вашингтоне (США). Одни участки обрабатывали органическими удобрениями, другие — нет. Удобренные почвы содержали больше бактерий, но доля резистентных к антибиотикам бактерий была ниже.