Если надо создать ярлык чего-то с запуском от root и чтобы перед запуском программы спросили пароль, то делаем следующее:

pkexec env DISPLAY=$DISPLAY XAUTHORITY=$XAUTHORITY КомандаКоторуюНадоВыполнить

Актуально только для Иксов, кстати. По моему в Wayland достаточно только pkexec
#Evv1LStuff