Mastodon está organizado en instancias, cualquiera puede descargarse el código del amigo Eugen y, siguiendo su tutorial, crear una. Mastodon es completamente libre, solo tiene 3 normas: no racismo, no xenofobia y no fascismo. Las instancias deben cumplir esas normas para aparecer en la página principal (joinmastodon.org/) y en la mayoría de instancias (incluyendo la más multitudinaria, mastodon.social, creada por el mismo creador del proyecto nuestro amigo Eugen).